NumSim

Este é um repositório para métodos numéricos em C++ e CPython. Os "metódos númericos" vão ser escritos em c++ e, por enquanto, a utilização do Python é repassar o dados iniciais para os metódos (em c++) e fazer a visualização da simulação (matplotlib).

Os "metodos" init dos "metódos númericos" são escritos em CPython.

Livro de referência: Numerical Simulation in Molecular Dynamics: Numerics, Algorithms, Parallelization, Applications by Michael Griebel, Gerhard Zumbusch, Stephan Knapek

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Instalação

A versão do Python utilizada na implementação é python3.7.

git clone https://github.com/ffernandoalves/NumSim.git
cd NumSim
python3.7 setup.py install

<!--- Usando virtualenv: git clone https://github.com/ffernandoalves/NumSim.git cd NumSim virtualenv -p /usr/bin/python3.7 venv source venv/bin/activate venv/bin/python3.7 setup.py install ex: ```venv/bin/python3.7 my_sim.py``` -->

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Exemplo

from numsim import init_verlet, load_data_generated, start_animation

data_in  = "examples/data/sun_system.csv"
data_out = "examples/data/output.csv"

init_verlet(data_in, data_out, delta_t=0.05, t_end=30.5)
df = load_data_generated(data_out)
start_animation(df)

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TODO

• [ ] Melhorar o modulo animation.py e torná-lo mais geral;

  • [x] Renomear nomes de variáveis, funções e classes;
  • [ ] Salvar simulação, formatos:
    • [x] mp4;
    • [x] gif;
    • [ ] image (png).
  • [ ] Ajustar o Time da simulação.

• [ ] Criar um script para manipulação de dados, em um arquivo separado, em c++ (ver velocity_verlet.cpp);

• [ ] Implementar os capítulos restantes [1].

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• [ ] Refazer a simulação em c++ (OpenGL).

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Referências

[1] Griebel, M.; Knapek, S.; Zumbush, G. Numerical Simulation in Molecular Dynamics; Springer: Berlin‐Heidelberg, 2007.

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Licença

MIT License.