19 skills found
majiayu000 / bio-annotationFunctional annotation and taxonomy inference from sequence homology.
majiayu000 / bio-microbiome-functional-predictionPredict metagenome functional content from 16S rRNA marker gene data using PICRUSt2. Infer KEGG, MetaCyc, and EC abundances from ASV tables
benjam3n / deExtract dependencies between steps, tasks, or items. Identifies what must happen before what, enabling proper sequencing. Read and execute `/home/ben/Documents/projects/reasoningtool/claude-code-plugin/skills/de/SKILL.md`, applying it to this input: $ARGUMENTS
miounet11 / ccjkClavue / Claude Code / Codex / Grok CLI 的医生+快捷操作员 — 扫描配置健康度，一键写入 API/MCP/工作流
rwi001 / biopythonComprehensive molecular biology toolkit. Use for sequence manipulation, file parsing (FASTA/GenBank/PDB), phylogenetics, and programmatic NCBI/PubMed access (Bio.Entrez). Best for batch processing, custom bioinformatics pipelines, BLAST automation. For quick lookups use gget;...
WPeace-HcH / wpegpt-analyzer驱动 IDA 配合 WPeGPT 插件对二进制可执行文件（PE/ELF）进行自动化逆向分析，输出包含程序用途、网络 IoC、可疑函数及漏洞评估的结构化报告。
MercurieVV / ScalaSemanticMCP server for deep semantic analysis of Scala via SemanticDB — exact find-usages, class hierarchies, implicit resolution & call paths for AI coding agents like Claude Code. Beyond grep and standard LSP.
SNagarjuna07 / shortlyaiProduction-grade URL shortener built with Java 25 + Spring Boot (4.1.0) microservices, Redis, Kafka, and Spring AI
Nlkomaru / 00_basicユーザーはClaudeよりプログラミングが得意ですが、時短のためにClaudeにコーディングを依頼しています。 2回以上連続でテストを失敗した時は、現在の状況を整理して、一緒に解決方法を考えます。 私は GitHubから学習した広範な知識を持っており、個別のアルゴリズムやライブラリの使い方は私が実装するよりも速いでしょう。ユーザーに説明しながらコードを書きます。
shyuan / writing-humanizerClaude Code plugin：去除文章中的 AI 寫作痕跡，使文字更自然、更有人味。以台灣正體中文為主。
char5742 / 00_basicユーザーはRooよりプログラミングが得意ですが、時短のためにRooにコーディングを依頼しています。 2回以上連続でテストを失敗した時は、現在の状況を整理して、一緒に解決方法を考えます。 私は GitHub
czcorpus / mqueryAn HTTP API and MCP server for mining language corpora using Manatee-Open engine.
hummat / paperpipeExtract equations and context from research papers for LLM coding assistants (arXiv, LaTeX, RAG)
mormorbump / 00_basicfsmによる状態遷移のサンプル
blazickjp / arxiv-mcp-serverA Model Context Protocol server for searching and analyzing arXiv papers
vitali87 / code-graph-ragThe ultimate RAG for your monorepo. Query, understand, and edit multi-language codebases with the power of AI and knowledge graphs
memtomem / memtomemMarkdown-first, long-term memory infrastructure for AI agents. Hybrid BM25 + semantic search across markdown/code files via MCP.
feiyun0112 / spec-coding-mcpTransform feature ideas into production-ready code through systematic Spec-Driven Development 通过系统化的**规格驱动开发**，将功能想法转化为可投入生产的代码
giancarloerra / SocratiCodeEnterprise-grade (40m+ LOC) codebase intelligence, zero-setup, local & private Plugin/Skill/Extension or MCP: hybrid semantic search, polyglot dependency graphs, symbol-level impact analysis & call-flow, interactive HTML viewer, cross-project & branch-aware search, DB/API/infra knowledge.
