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majiayu000 / bio-annotationFunctional annotation and taxonomy inference from sequence homology.
majiayu000 / bio-microbiome-functional-predictionPredict metagenome functional content from 16S rRNA marker gene data using PICRUSt2. Infer KEGG, MetaCyc, and EC abundances from ASV tables
rwi001 / biopythonComprehensive molecular biology toolkit. Use for sequence manipulation, file parsing (FASTA/GenBank/PDB), phylogenetics, and programmatic NCBI/PubMed access (Bio.Entrez). Best for batch processing, custom bioinformatics pipelines, BLAST automation. For quick lookups use gget;...
Nlkomaru / 00_basicユーザーはClaudeよりプログラミングが得意ですが、時短のためにClaudeにコーディングを依頼しています。 2回以上連続でテストを失敗した時は、現在の状況を整理して、一緒に解決方法を考えます。 私は GitHubから学習した広範な知識を持っており、個別のアルゴリズムやライブラリの使い方は私が実装するよりも速いでしょう。ユーザーに説明しながらコードを書きます。
WPeace-HcH / wpegpt-analyzer驱动 IDA 配合 WPeGPT 插件对二进制可执行文件（PE/ELF）进行自动化逆向分析，输出包含程序用途、网络 IoC、可疑函数及漏洞评估的结构化报告。
MatthewZMD / aidermacsAI Pair Programming in Emacs with Aider
waxberry-dev / live-translate-mcpMCP server for local speech translation (EN ↔ 中文) via Whisper + Claude + Piper
vitali87 / code-graph-ragThe ultimate RAG for your monorepo. Query, understand, and edit multi-language codebases with the power of AI and knowledge graphs
memtomem / memtomemMarkdown-first, long-term memory infrastructure for AI agents. Hybrid BM25 + semantic search across markdown/code files via MCP.
swjturay / codex-agy-delegatorAn MCP server for delegating repetitive coding tasks from Codex to Antigravity workers in isolated Git worktrees.
CreateSun / cursor-rulesCursor rules: RIPER-5, A more efficient Chinese translation version.
miounet11 / ccjkClavue / Claude Code / Codex / Grok CLI 的医生+快捷操作员 — 扫描配置健康度，一键写入 API/MCP/工作流
mormorbump / 00_basicfsmによる状態遷移のサンプル
tninja / aider.elAI assisted programming in Emacs with Aider
olimorris / codecompanion.nvim✨ AI Coding, Vim Style
noriaki / 00_basicユーザはプログラミングが得意ですが、時短のために私にコーディングを依頼しています。 2回以上連続でテストを失敗した時は、現在の状況を整理して、一緒に解決方法を考えます。 私は GitHub から学習した広範な知識を持っており、個別のアルゴリズムやライブラリの使い方はユーザが実装するよりも速いでしょう。テストコードを書いて動作確認しながら、ユーザに説明しながらコードを書きます。
OpenBMB / UltraRAGA Low-Code MCP Framework for Building Complex and Innovative RAG Pipelines
shenlian19831109 / progmune-runtimeProgmune Runtime — Program Immunology: A constraint-guided program synthesis runtime for verifiable AI-generated code
